近日，畜牧所牛羊遗传改良与健康养殖创新团队在奶牛育种研究方面取得重要进展，相关研究以题为“A sequence-based genome-wide association study for dominance effects on fertility traits in Holstein cattle”发表于国际权威期刊《Animal》（Top 5%期刊）。该研究首次在奶牛繁殖性状中系统整合显性效应开展全基因组关联分析，精准揭示了显性效应对低遗传力繁殖性状的遗传调控作用，为非加性遗传效应的挖掘与应用构建了新的研究方法。

繁殖性状是奶牛产业核心经济性状，直接影响养殖效益与产业发展，但该类性状普遍存在遗传力偏低的特点，遗传力仅维持在2%-16%。传统加性全基因组关联分析技术存在明显局限性，仅能解析小部分遗传变异，大量关键的显性遗传效应如同基因组“暗物质”长期未被挖掘利用。为破解这一瓶颈，牛羊团队以我国南方荷斯坦牛为研究对象，系统采集8项关键繁殖性状表型数据，通过100K芯片完成基因型检测并实现全基因组序列精准填充。研究创新采用可同步估算加性、显性双重效应的混合线性模型，在单标记层面完成显性遗传方差的系统性量化分析。在全基因组范围内鉴定出505个具有显著显性效应的SNP位点，其中13个关键候选基因无法通过传统加性分析方法检出，显性效应的应用直接将繁殖性状遗传位点检测效能提升14%。通过精细基因定位，锁定一批调控荷斯坦牛繁殖性状的关键候选基因如ASB3、CYP2C19、GPR75、GUSB、LY6E、LY6K、LY6D、PSME4等。尤为重要的是，CYP2C19等3个核心基因仅受显性效应特异性调控，直接证实了杂合子优势在奶牛部分繁殖性状调控中的独特作用与不可替代性。

该研究首次系统解析了荷斯坦牛繁殖性状的显性效应，成功构建了“加性+显性”育种新方法，为畜禽非加性效应的育种应用提供了实践案例，为奶牛遗传改良提供了理论支撑与技术参考。畜牧所牛羊遗传改良与健康养殖创新团队硕士研究生李文洁为论文第一作者，夏淑雯助理研究员为论文通讯作者。该研究得到了科技创新2030-农业生物育种重大项目课题（2023ZD0404902）资助。

论文全文链接：https://doi.org/10.1016/j.animal.2026.101851